浙江省自然科学基金委员会是一个具有学术和管理双重性质的机构，下设浙江省自然科学基金委员会办公室，具体负责浙江省自然科学基金的日常管理工作。浙江省自然科学基金委员会自成立以来，全面引入和实施了先进的基金制资助模式和管理理念，确立了“依靠专家、发扬民主、公平公正”的评审原则，形成了“宏观引导、自主申报、同行评议、平等竞争、择优支持”的运行机制，建立了评审、决策、执行、监督、咨询相互协调的科学基金管理体系并制订了一系列管理规定。