中华人民共和国卫生部网站主要设有政府信息和业务频道二个区，政府信息区设置了机构职能、政策法规、规划计划、行政许可、卫生标准、卫生统计、工作动态、通告公告等栏目；业务频道区设有综合管理、人事管理、规划财务、政策法规、卫生应急、疾病控制、爱国卫生、、农村卫生、妇幼保健、社区卫生、健康教育、医政管理、医疗监管、食品安全、卫生监督、药政管理、科技教育、国际合作、港澳台合作、、精神文明、离退管理、纪检监察、行风建设、信息化建设等栏目，内容涵盖了中华人民共和国卫生部工作的方方面面，是卫生系统最具权威的网站。