交通运输部质监局主要是拟定公路水运工程质量监督方面的管理规定；指导省级交通质量监督机构开展公路水运工程质量监督工作；组织对重点公路水运建设项目质量检查和竣工验收前的质量鉴定；受理工程质量问题投诉，参与对重大工程质量事故的调查处理；负责组织全国甲、乙级公路水运工程监理单位资质评审；负责公路水运工程监理工程师执业资格考试管理；负责全国公路水运工程试验检测管理；负责公路水运基础设施建筑安全生产监督管理。